药剂科是集药品生产供应、药事管理、药学服务、科学研究为一体的重要科室，下设门急诊药房、住院药房、静脉用药调配中心、药库、制剂室、药检室、临床药学室等部门。负责组织开展院内药品及化学试剂采购供应、质量控制、制剂生产、药品调剂、合理用药服务、药学研究等工作。
现有药学专业人员126名，其中主任药师3名，副主任药师6名，主管药师78名，具有博士学位人员3名，硕士学位人员68名。拥有浙江大学药理学硕士研究生导师2名、浙江省151人才培养对象1人、浙江省医坛新秀培养对象1人。
2012年获批为全国临床药师培训基地，现有三个小儿用药专业带教组，已完成来自全国15省市40余名临床药师的规范化培训。为浙江大学医学院药理学硕士研究生招生培养点，同时承担浙江大学城市学院、杭州医学院、金华职业技术学院等院校药学专业本科毕设生及实习生的培养和带教工作。
曾荣获“全国五一巾帼标兵岗”、“全国信息工作先进单位”、“浙江省医院药事管理优秀奖”、“浙江省药品不良反应监测工作优秀集体”等荣誉称号。
